Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOCS1O15524 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOCS1O15524 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms