Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNMO15061 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNMO15061 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNMO15061 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNMO15061 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNMO15061 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNMO15061 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNMO15061 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNMO15061 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNMO15061 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYNMO15061 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYNMO15061 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYNMO15061 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNMO15061 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNMO15061 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNMO15061 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNMO15061 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNMO15061 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNMO15061 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNMO15061 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNMO15061 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNMO15061 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNMO15061 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNMO15061 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNMO15061 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNMO15061 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNMO15061 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNMO15061 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNMO15061 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNMO15061 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNMO15061 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNMO15061 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNMO15061 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNMO15061 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNMO15061 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNMO15061 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNMO15061 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNMO15061 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNMO15061 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNMO15061 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNMO15061 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNMO15061 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNMO15061 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNMO15061 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNMO15061 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNMO15061 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNMO15061 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNMO15061 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNMO15061 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNMO15061 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms