Protein–RNA interactions for Protein: O13539

THP2, THO complex subunit THP2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2O13539 snR83snR83 306 nt0.97□□□□□ -2.25
THP2O13539 YLR198CYLR198C 360 nt0.97□□□□□ -2.25
THP2O13539 YNL114CYNL114C 372 nt0.97□□□□□ -2.25
THP2O13539 GDS1YOR355W 1569 nt0.96□□□□□ -2.26
THP2O13539 YJR029WYJR029W 5268 nt0.96□□□□□ -2.26
THP2O13539 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.96□□□□□ -2.26
THP2O13539 ZIP1YDR285W 2628 nt0.96□□□□□ -2.26
THP2O13539 ROM2YLR371W 4071 nt0.96□□□□□ -2.26
THP2O13539 EAF1YDR359C 2949 nt0.96□□□□□ -2.26
THP2O13539 IML1YJR138W 4755 nt0.96□□□□□ -2.26
THP2O13539 NUP145YGL092W 3954 nt0.96□□□□□ -2.26
THP2O13539 SPT21YMR179W 2277 nt0.95□□□□□ -2.26
THP2O13539 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.95□□□□□ -2.26
THP2O13539 RPC10YHR143W-A 213 nt0.95□□□□□ -2.26
THP2O13539 YML003WYML003W 873 nt0.95□□□□□ -2.26
THP2O13539 NUT1YGL151W 3399 nt0.95□□□□□ -2.26
THP2O13539 YGR130CYGR130C 2451 nt0.95□□□□□ -2.26
THP2O13539 MSS11YMR164C 2277 nt0.95□□□□□ -2.26
THP2O13539 PIP2YOR363C 2991 nt0.95□□□□□ -2.26
THP2O13539 CDC24YAL041W 2565 nt0.95□□□□□ -2.26
THP2O13539 PRM8YGL053W 714 nt0.94□□□□□ -2.26
THP2O13539 ANS1YHR126C 480 nt0.94□□□□□ -2.26
THP2O13539 YIR020CYIR020C 303 nt0.94□□□□□ -2.26
THP2O13539 YMR254CYMR254C 309 nt0.94□□□□□ -2.26
THP2O13539 STB6YKL072W 2301 nt0.94□□□□□ -2.26
THP2O13539 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.93□□□□□ -2.26
THP2O13539 SWI5YDR146C 2130 nt0.93□□□□□ -2.26
THP2O13539 SCEIQ0160 708 nt0.93□□□□□ -2.26
THP2O13539 SPO13YHR014W 876 nt0.93□□□□□ -2.26
THP2O13539 RPS18BYML026C 441 nt0.93□□□□□ -2.26
THP2O13539 HCH1YNL281W 462 nt0.93□□□□□ -2.26
THP2O13539 DCP1YOL149W 696 nt0.93□□□□□ -2.26
THP2O13539 YBR063CYBR063C 1215 nt0.93□□□□□ -2.26
THP2O13539 TTI1YKL033W 3117 nt0.93□□□□□ -2.26
THP2O13539 NOC3YLR002C 1992 nt0.92□□□□□ -2.26
THP2O13539 APL3YBL037W 3078 nt0.92□□□□□ -2.26
THP2O13539 QCR7YDR529C 384 nt0.92□□□□□ -2.26
THP2O13539 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.92□□□□□ -2.26
THP2O13539 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
THP2O13539 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
THP2O13539 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
THP2O13539 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
THP2O13539 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
THP2O13539 YOP1YPR028W 543 nt0.92□□□□□ -2.26
THP2O13539 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.91□□□□□ -2.26
THP2O13539 BEM2YER155C 6504 nt0.91□□□□□ -2.26
THP2O13539 KAP120YPL125W 3099 nt0.91□□□□□ -2.26
THP2O13539 AFR1YDR085C 1863 nt0.9□□□□□ -2.26
THP2O13539 CDC39YCR093W 6327 nt0.9□□□□□ -2.26
THP2O13539 YDL187CYDL187C 330 nt0.9□□□□□ -2.27
THP2O13539 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.9□□□□□ -2.27
THP2O13539 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.9□□□□□ -2.27
THP2O13539 YLR252WYLR252W 306 nt0.9□□□□□ -2.27
THP2O13539 ERP4YOR016C 624 nt0.9□□□□□ -2.27
THP2O13539 YBR071WYBR071W 636 nt0.9□□□□□ -2.27
THP2O13539 YPR099CYPR099C 357 nt0.9□□□□□ -2.27
THP2O13539 SLM6YBR266C 453 nt0.9□□□□□ -2.27
THP2O13539 PIG1YLR273C 1947 nt0.89□□□□□ -2.27
THP2O13539 BUD3YCL014W 4911 nt0.89□□□□□ -2.27
THP2O13539 GPM2YDL021W 936 nt0.89□□□□□ -2.27
THP2O13539 YEL057CYEL057C 702 nt0.89□□□□□ -2.27
THP2O13539 AFB1YLR040C 675 nt0.89□□□□□ -2.27
THP2O13539 YLR366WYLR366W 306 nt0.89□□□□□ -2.27
THP2O13539 snR14snR14 160 nt0.89□□□□□ -2.27
THP2O13539 PAN3YKL025C 2040 nt0.89□□□□□ -2.27
THP2O13539 YJR087WYJR087W 351 nt0.88□□□□□ -2.27
THP2O13539 YOL029CYOL029C 606 nt0.88□□□□□ -2.27
THP2O13539 MPT5YGL178W 2580 nt0.88□□□□□ -2.27
THP2O13539 SMC1YFL008W 3678 nt0.87□□□□□ -2.27
THP2O13539 YDR509WYDR509W 348 nt0.87□□□□□ -2.27
THP2O13539 YGR045CYGR045C 363 nt0.87□□□□□ -2.27
THP2O13539 YJR079WYJR079W 330 nt0.87□□□□□ -2.27
THP2O13539 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.87□□□□□ -2.27
THP2O13539 YBR012CYBR012C 420 nt0.87□□□□□ -2.27
THP2O13539 YOR248WYOR248W 303 nt0.87□□□□□ -2.27
THP2O13539 GRX5YPL059W 453 nt0.87□□□□□ -2.27
THP2O13539 AIM44YPL158C 2277 nt0.87□□□□□ -2.27
THP2O13539 TOF2YKR010C 2316 nt0.86□□□□□ -2.27
THP2O13539 HNT1YDL125C 477 nt0.86□□□□□ -2.27
THP2O13539 SLX9YGR081C 633 nt0.86□□□□□ -2.27
THP2O13539 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.86□□□□□ -2.27
THP2O13539 IRC23YOR044W 474 nt0.86□□□□□ -2.27
THP2O13539 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.86□□□□□ -2.27
THP2O13539 PAU24YBR301W 363 nt0.86□□□□□ -2.27
THP2O13539 SCC2YDR180W 4482 nt0.86□□□□□ -2.27
THP2O13539 SRP14YDL092W 441 nt0.85□□□□□ -2.27
THP2O13539 YDR008CYDR008C 351 nt0.85□□□□□ -2.27
THP2O13539 YDR114CYDR114C 303 nt0.85□□□□□ -2.27
THP2O13539 MKT1YNL085W 2493 nt0.85□□□□□ -2.27
THP2O13539 IFH1YLR223C 3258 nt0.85□□□□□ -2.27
THP2O13539 HIT1YJR055W 495 nt0.84□□□□□ -2.27
THP2O13539 GMC2YLR445W 567 nt0.84□□□□□ -2.27
THP2O13539 YBR032WYBR032W 303 nt0.84□□□□□ -2.27
THP2O13539 PPN1YDR452W 2025 nt0.83□□□□□ -2.28
THP2O13539 RTT102YGR275W 474 nt0.83□□□□□ -2.28
THP2O13539 SPO11YHL022C 1197 nt0.83□□□□□ -2.28
THP2O13539 NUT2YPR168W 474 nt0.83□□□□□ -2.28
THP2O13539 SAS3YBL052C 2496 nt0.83□□□□□ -2.28
THP2O13539 SPO23YBR250W 1572 nt0.83□□□□□ -2.28
THP2O13539 LYS14YDR034C 2373 nt0.82□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.3 ms