Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00587B1AMM8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms