Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BECN2A8MW95 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN2A8MW95 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms