Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L3A6NEY3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms