Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L4A6NEF3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L4A6NEF3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms