Protein–RNA interactions for Protein: A6NDG6

PGP, Glycerol-3-phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPA6NDG6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PGPA6NDG6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGPA6NDG6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms