Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37CA5D8V6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37CA5D8V6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms