Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMX2A2RU54 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms