Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC78A2IDD5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC78A2IDD5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms