Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms