Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A4Q9Y6R1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms