Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPN6Q9Y6Q1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN6Q9Y6Q1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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