Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S1

TRPV2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV2Q9Y5S1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPV2Q9Y5S1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRPV2Q9Y5S1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms