Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB2Q9Y5E7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms