Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms