Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms