Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF13BQ9Y275 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF13BQ9Y275 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms