Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CEP164Q9UPV0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CEP164Q9UPV0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP164Q9UPV0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP164Q9UPV0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP164Q9UPV0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP164Q9UPV0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP164Q9UPV0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP164Q9UPV0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP164Q9UPV0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms