Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SMG5Q9UPR3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMG5Q9UPR3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms