Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM35Q9UPQ4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms