Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN2Q9UNF0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms