Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms