Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms