Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUF60Q9UHX1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms