Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP25Q9UHP3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms