Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DDX20Q9UHI6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms