Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
KDM5BQ9UGL1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM5BQ9UGL1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms