Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms