Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CC2D2AQ9P2K1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CC2D2AQ9P2K1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms