Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHD7Q9P2D1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD7Q9P2D1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms