Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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CNTN3Q9P232 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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CNTN3Q9P232 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTN3Q9P232 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTN3Q9P232 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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