Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MIS18AQ9NYP9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms