Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC25Q9NXE8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC25Q9NXE8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms