Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ASF1BQ9NVP2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms