Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZCCHC3Q9NUD5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms