Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms