Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC6A13Q9NSD5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A13Q9NSD5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms