Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TOPORSQ9NS56 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOPORSQ9NS56 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms