Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms