Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRN4Q9NRL3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRN4Q9NRL3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRN4Q9NRL3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms