Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DUOX1Q9NRD9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUOX1Q9NRD9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms