Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGB3Q9NQW8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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CNGB3Q9NQW8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGB3Q9NQW8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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