Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms