Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
A4GALTQ9NPC4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms