Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP4Q9C0A0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTNAP4Q9C0A0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTNAP4Q9C0A0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTNAP4Q9C0A0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTNAP4Q9C0A0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTNAP4Q9C0A0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTNAP4Q9C0A0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP4Q9C0A0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP4Q9C0A0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP4Q9C0A0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP4Q9C0A0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP4Q9C0A0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP4Q9C0A0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms