Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRNKL1Q9BZJ0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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