Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms