Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PACSIN1Q9BY11 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PACSIN1Q9BY11 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms